< Tests

ما هي الأساليب التي يمكن أن تسرع عملية الفحص على نطاق واسع؟

تم تحديث النص 2020-11-01


تتطلب حالات التعقب تسريع الاختبارات واسعة النطاق وتعميمها. اختبارات بسيطة وسريعة متاحة بالفعل، بديل للاختبارات المرجعية (أخذ عينات البلعوم الأنفي وقياس "RT-qPCR"): 1) لجعل العينات بسيطة، مستقلة، آمنة من التلوث والحد الأدنى من التوغل: يمكن أن تستند أخذ العينات على اللعاب الذي يحتوي على الكثير من الفيروسات (انظر "ما هي العينة لاختبار وجود فيروس كورونا: البلعوم الأنفي أو عن طريق الفم؟")؛ 2) من أجل تقليل مدة الاختبار، وطرق الكشف السريع تسمح الكشف المباشر من مستضدات الفيروس (ما يسمى "antigenic" الاختبارات). لعدم تفويت الحالات ذات الحمل الفيروسي المنخفض ، يوجد اختبار آخر مع خطوة تضخيم سريعة: هذا هو أسلوب "RT-LAMP" ؛ 3) للحد من عدد الاختبارات التي يتعين القيام بها للكشف عن الحالات على نطاق واسع الكوفيد-١٩ ، ينبغي أن يخطط لدمج العينات في مجموعات، وهي طريقة تعرف باسم "التجميع. راجع "تجميع: لماذا وماذا؟"

ملاحظه. من المهم التمييز بين اختبارات الكشف عن الفيروسات التي تحدد ما إذا كنت مصابًا بالفيروس حاليًا (انظر "ما هو اختبار الأساس لمعرفة ما إذا كنت مصابة بالسارس -COV-2؟" اختبارات المصلية لتحديد أننا قد أصيبنا بالفيروس عن طريق الكشف عن استجابتنا المناعية (انظر "ما هي الاختبارات لمعرفة ما إذا كان لي من أي وقت مضى الكوفيد-١٩ ? »).

يمكن أن تكون اختبارات الكشف عن الفيروس في إفرازات الجسم لدينا حساسة للغاية من خلال عملية تضخيم الفيروس (PCR أو طريقة RT-LAMP) أو غير حساسة إذا تم الكشف عن الفيروس مباشرة دون تضخيم الفيروس (ما يسمى اختبارات "antigenic").

اللعاب: طريقة بسيطة ومستقلة وأقل عرضة لأخذ العينات. في الآونة الأخيرة ، تم العثور على اختبارات تستند إلى تحليل اللعاب لتكون حساسة لأن الحمل الفيروسي مرتفع. لأن جمع اللعاب أمر سهل، يمكن للأفراد حتى جمع أنفسهم بشكل مستقل.

ومن المدهش أن الفيروس مستقر جدا في اللعاب: فهو يقاوم لأكثر من أسبوع في درجة حرارة الغرفة، وأكثر من 2 أسابيع في 4oC وأشهر في الفريزر في -80oC. وهكذا، يمكن أن يكون نظام جمع العينات اللعابية بسيطة وغير مكلفة.

لجميع هذه الأسباب، اختبارات اللعاب واعدة جدا لاختبار سريع وواسع النطاق. انظر السؤال "ما عينة لاختبار وجود فيروس كورونا: البلعوم الأنفي أو عن طريق الفم؟"

قم بإجراء اختبارات أقل لتحديد الحالات الإيجابية وتقليل تكلفة الاختبار عن طريق تجميع العينات. ويمكن أن يساعد الجمع بين العينات المأخوذة من عدة أشخاص في نفس الأسرة في مجمع واحد على تحقيق الحد الأمثل من اكتشاف حالات تفشي العدوى بين السكان. راجع الأسئلة "تجميع: لماذا ولماذا؟" و "ما هي مخاطر السلبيات الزائفة في اختبارات المجموعة؟" تعمل تقنية تجميع عينات التجميع على تقليل عدد الاختبارات القياسية لكل PCR ليتم إجراؤها، مما يوفر الوقت والكفاءة في اكتشاف الحالات، فضلاً عن تقليل التكاليف. فمن الممكن لمجموعة العينات، وبرك الاختبار وفي حالة الإيجابية لإعادة اختبار الأفراد بشكل منفصل.

الكشف عن الفيروس عن طريق التضخيم السريع للتسلسل الفيروسي للفحص الفردي والجماعي: طريقة RT-LAMP والأمل في نهج مصباح- seq. 

توجد اختبارات تستند إلى تفاعل البوليميراز المتسلسل ("PCR") أسرع من الـ RT-qPCR مثل RT-LAMP وهي تقنية تضخيم متساوي thermic ذات توسط حلقي يمكن إجراؤها في نصف ساعة. يمكن استخدام هذه الطريقة للفحص الفردي ويتم تسويقها في فرنسا للعينات اللعابية بواسطة SkillCell (EasyCov Test).

تم تكييف طريقة RT-LAMP في دليل حديث على مفهوم الفحص على نطاق واسع: هذا هو نهج LAMPseq. من خلال إضافة "الباركود" إلى عينة كل فرد، فمن الممكن الجمع بين عينات من أفراد متعددة (تصل إلى عشرات الآلاف) وتحديد نتيجة كل فرد في اختبار واحد! الباركود هو تسلسل صغير من الحمض النووي لصقها على التمهيديات التي تستخدم لتضخيم الجينوم الفيروس. حتى إذا كانت واحدة من العينات تحتوي على فيروس كورونا، سيتم تضخيم التسلسل الفيروسي في نفس الوقت مع الباركود تحديد الفرد. من خلال تسلسل ضخمة، فمن الممكن لتتبع الشخص الذي يحمل الفيروس داخل تجمع. "LAMPseq" بالضرورة وقتاً أطول من نصف ساعة من RT-LAMP لمعالجة عشرات الآلاف من العينات تسلسل وتفسير التسلسلات. ومع ذلك، فإنه ليس من الضروري مع هذا النهج لإعادة اختبار نفس العينات لأننا نعرف هوية كل فرد في مزيج العينة بفضل الباركود. لاحظ أن معدل الإيجابية للحالات الكوفيد-١٩ في مجموعة الاختبار فرض قيود على عدد العينات التي سيتم تجميعها مع هذا الأسلوب.

العثور على حالات إيجابية عالية الملوثات بسرعة عن طريق الكشف عن الجزيئات على سطح الفيروس: اختبارات غير حساسة ولكن سريعة antigenic. في حين أن اختبارات PCR تكشف عن المادة الوراثية للسارس-COV-2 (RNA)، تكشف الاختبارات الخافدة الجزيئات على سطح الفيروس، وعادة ما يكون البروتين النووي. هذه الاختبارات سريعة (أقل من 30 دقيقة) ويمكن أن تكون مفيدة للكشف عن الأشخاص الذين يعانون من حمولة فيروسية عالية والذين سيكونون قادرين على تلويث فعال خلال حدث جماعي. هذه الاختبارات محددة جدا للفيروس، لكنها ليست حساسة مثل التدابير القائمة على PCR التي تكشف عن تسلسل الفيروس بعد عملية التضخيم. ونتيجة لذلك، هذه الاختبارات antigenic يكون أعلى خطر من ارتكاب أخطاء سلبية كاذبة. بسبب الحساسية المنخفضة لهذه الاختبارات، يتم تشجيع حالات الأعراض أو الاتصال مع اختبار مضاد للحساسية السلبية لتأكيد نتائجها مع اختبار PCR أكثر حساسية.


فيسبوك تويتر Linkedin

المصادر

واحدة من الدراسات الأولى التي تشير إلى حد الثقة في الاختبارات اللعابية.

Azzi, L., Carcano, G., Gianfagna, F., Grossi, P., Dalla Gasperina, D., Genoni, A., ... & Maurino, V. (2020). Saliva is a reliable tool to detect SARS-CoV-2. Journal of Infection.

واحدة من الدراسات الأولى التي تشير إلى حد الثقة في الاختبارات اللعابية.

Williams, E., Bond, K., Zhang, B., Putland, M., Williamson, D.A. (2020) Saliva as a non-invasive specimen for detection of SARS-CoV-2. J Clin Microbiol. pii: JCM.00776-20.

الباحثون في جامعة ييل تبين أن اختبارات اللعاب هي أكثر حساسية من تلك التي أجريت على عينات البلعوم الأنفي (ن -70 المرضى COVID):

ويلي، أ. ل.، فورنييه، ج. ، كازانوفاس - ماسانا، أ. ، كامبل، م. ، توكوياما، م. ، فيجاياكومار، ب. ، ... - بيترون، م. إ. (2020). اللعاب هو أكثر حساسية للكشف عن السارس-CoV-2 في الكوفيد-١٩ المرضى من مسحات البلعوم الأنفي. مجلة نيو إنجلاند للطب، 24 سبتمبر 2020، 383: 1283-1286.

الفيروس مستقر في اللعاب لأكثر من أسبوع في درجة حرارة الغرفة، أكثر من 2 أسابيع في 4oC وأشهر في الفريزر في -80oC. وتشير هذه الملاحظات إلى أن من الممكن إنشاء نظام بسيط وغير مكلف لجمع المعلومات:

Ott، IM، Strine، MS، واتكينز، AE، التمهيد، M، Kalinich، CC، هاردن، كاليفورنيا، Vogels، CBF، كازانوفاس ماسانا، أ، مور، AJ، Muenker، MC، ناكاهاتا، M، توكوياما، م، نيلسون، A، فورنييه، J، Bermejo، S، كامبل، M، داتا، R، ديلا كروز، CS، فرهادين، SF، كو، الذكاء الاصطناعي، Iwasaki، A، Grubaugh، ND، ويلين، CB، Wyllie، AL ببساطة: استقرار اللعاب من سارس-CoV-2

تظهر دراسة COVISAL الفرنسية التي أجريت في غابات الأمازون المطيرة في غيانا الفرنسية اهتمام وسهولة جمع اللعاب. وتكشف الدراسة الميدانية عن وجود اختلافات بين المجموعات التي تؤخذ في ظروف المختبر (جامعة ييل، جامعة هوكايدو) وفي الميدان. أدت هذه الدراسة باستخدام 25 حالة بدون أعراض إلى قيام الهيئة الصحية العليا بإجراء اختبارات لعابية فقط على الأشخاص الذين يعانون من الأعراض (https://www.has-sante.fr/jcms/p_3202317/fr/ الكوفيد-١٩ -الاختبارات-اللعاب-يمكن إكمال-الاختبارات-nasopharynges-at-the-people-symptomatics)

ناشر، M، Mergeay-فابر، M، بلانشيت، D، بينويس، O، Pozl، T، Mesphoule، P، سانت روز، V, Vialette, V, Toulet, B, Moua, A, Simon, S, Guidarelli, M, Galindo, M, B, Faurous, W, Abad, F, Fahrasmane, A, Rochemont, D, Vignier, N, Vabret, A, Demar, M. COVISAL غيانا, ناشر, M, Demar, M. الكوفيد-١٩ . COVISAL غيانا، ناشر، M، ديمار، M. مقارنة محتملة من اللعاب وأخذ عينات مسحة البلعوم الأنفي للفحص الشامل لل الكوفيد-١٩ .

ويمكن أن يؤدي توحيد العينات داخل الأسرة المعيشية إلى تحقيق أفضل ما يمكن من اكتشاف حالات تفشي العدوى في صفوف السكان:

Hogan, C. A., Sahoo, M. K., & Pinsky, B. A. (2020). Sample Pooling as a Strategy to Detect Community Transmission of SARS-CoV-2. JAMA.

أظهرت دراسة يابانية حديثة لـ 55 حالة COVID غير أعراض أن اللعاب هو طريقة فعالة للغاية لأخذ العينات sarS-CoV-2 حتى في المرضى الذين لا تظهر أعراضهم: حساسية 92٪ لأخذ عينات اللعابية في حين 86٪ لأخذ عينات البلعوم الأنفية ، مع احتمال 99.8٪ من التوافق. أجريت الاختبارات على أكثر من 1950 شخصًا يتصلون بالمطارات أو يصلون ها إلى المطارات:

يوكوتا، الأول، شين، ف، أوكادا، ك، أونوكي، ي، يانغ ي، تاسوكو، أنا، ساكاكاكي، ك، إيواساكي، س، هاياساكا، ك، سوغيتا، ياء، نيشيدا، M، فوجيساوا، S، تيشيما، ت. (2020). الفحص الشامل للأشخاص الذين لا أعراضهم للكشف عن السارس-CoV-2 باستخدام اللعاب. 10.1101/2020.08.13.20174078.

وخلصت دراسة يابانية شملت 103 حالات إيجابية تقارن بين أنظمة RT-qPCR المختلفة ونظام RT-LAMP إلى أن RT-qPCR كان أكثر حساسية.

إيكيدا، إماي، ك، تاباتا، س، ميوشي، ك، ميزونو، ت، موراهارا، ن، هوريوتشي، م، كاتو، ك، إيموتو، ي، إيواتا، م. التقييم السريري للعاب الذي تم جمعه ذاتيًا بواسطة RT-qPCR، RT-qPCR المباشر، RT-LAMP، واختبار مستضد سريع لتشخيص الكوفيد-١٩ . 10.1101/2020.06.06.20124123.

يمكن لمجموعة اكتشاف EasyCOV باستخدام RT-LAMP بعد المعالجة المسبقة للعاب الكشف عن السارس-Cov-2 في 40 دقيقة بحساسية 87.5٪ وفقًا لدراسةهم الأولى التي أجريت على 220 شخصًا.

ومن المتوقع أن يتم دمج ما مجموعه 720 شخصاً بحلول نهاية الدراسة.

وقد تم تطوير تقنية LAMP-SEQ والتحقق من صحتها على مجموعة من 28 فردًا، كان 12 منهم إيجابيًا من قبل RT-PCR. وتم تحديد 12 فردا من أصل 12 شخصا على أنهم إيجابيون مع نهج "المصابيح- سيا". 10- وتتوقف معدلات الخطأ والإيجابية الكاذبة على شروط التنفيذ الدقيقة وتفرض قيوداً على المعدل الأقصى للحالات الإيجابية لدى السكان المستهدفين:

شميد- بورغ، جي ال، شميتهاوزن، جمهورية مقدونيا، لي، د، هولشتاين، ر، بن شموئيل، أ، إسرائيلي، O، فايس، S، باران، ن، ويلبرينغ، G، ليبينغ، J، فيلدمان، D، Saabicki، M، ليبكي، B، سيب، E، بورارجو، J، Strecker، J، راينهارت، J، هوفمان، P، كليري، P، Helzel، M، Nethen، MM، إكسنر، M، لودفيغ، KU، Regev، A، الكوفيد-١٩ التشخيص باستخدام التكويد الناكناتوري.

الاختبارات التي تم تجميعها من 5 إلى 20 في عينات اللعابية من قبل فريق جامعة ييل أيضًا خلف اختبار SalivaDirect:

واتكينز، أ. إ. ، فينيشيل، إ. ب. ، واينبرغر، د.M. ، فوغلز، سي.B، براكني، د. إ. ، كازانوفاس - ماسانا، أ. ، ... - كروز، سي إس د (2020). تجميع اللعاب لزيادة قدرة اختبار السارس-CoV-2. ميدريفست.

اختبارات جماعية من 5 إلى 30 في ألمانيا، في أرض سارلاند، لأغراض الوقاية من الأوبئة:

Lohse، S.، Pfuhl، T.، بيرك-gttel، B.، ريسلاند، J.، جاي- لير، T.، Gortner، B.، ... - سمولا، S. (2020). تجميع عينات لاختبار السارس-CoV-2 في الأشخاص الذين لا يعانون من أعراض. إنست الأمراض المعدية.

دراسة تدرس خصوصية وحساسية "كوريس" اختبار مضداد سريع الكوفيد-١٩ Ag Respi-Strip" على 106 عينات: إذا كان الاختبار محددًا (100٪)، فإن معدل الكشف عن الحالات الإيجابية منخفض جدًا (30٪).

سكوهي، أ. ، أنانثاراجا، أ. ، بوديوس، م.، كابامبا - موكادي، ب. ، فيروكين، أ. ، رودريغيز - فيلالوبوس، ه. (2020). انخفاض أداء اختبار الكشف عن المستضد السريع كاختبار في الخطوط الأمامية لل الكوفيد-١٩ التشخيص. مجلة علم الفيروسات السريرية: النشر الرسمي لجمعية البلدان الأمريكية لعلم الفيروسات السريرية، 129، 104455.

كشفت دراسة يابانية تدرس أداء اختبار المضادات الضوئية LUMILUSTRE على 313 عينة أن هذه الاختبارات محددة جدًا لسارس-CoV-2 (99.6%) لكنها ليست حساسة جدا (حساسية 55.2٪ مقارنة اختبارات الكشف عن فيروس PCR).

هيروتسو، Y، Maejima، M، شيبوساوا، M، M، Nagakubo، Y، هوساكا، K، أميمية، K، سوكي، H، هاياكاوا، M، Mochizuki، H، تسوتسوي، T، كاكيزاكي، Y، مياشيتا، ي، ياغي، S، Kojima، S، أوماتا، M. مقارنة سارس-CoV الآلي الكوفيد-١٩ العدوى مع كمية RT-PCR باستخدام 313 مسحة البلعوم الأنفي، بما في ذلك من سبعة المرضى يتبع تسلسليا. Int J تصيب ديس. 2020 أكتوبر/ تشرين الأول؛ 2011 99: 397–402. دوي: 10.1016/j.ijid.2020.08.029

يمكن أن تحدد الاختبارات المناعية السريعة للفلوري لمستضد SARS-CoV-2 المرضى في غضون الأيام الخمسة الأولى بعد ظهور الأعراض ، عندما تحمل إفرازات الجهاز التنفسي أحمالًا فيروسية عالية ، مما يشير إلى أن هذه الاختبارات قد تلعب دورًا مهمًا في الاستراتيجيات المستقبلية المستقلة PCR للكشف عن الحالات المبكرة أو المعدية:

بورت، L، Legarraga، P، Iruretagoyena، M، Vollrath، V، بيزارو، G، مونيتا، JM، آراوس، R، Weitzel، T. RAPID SARS-CoV-2 الكشف عن المضادات بواسطة الفلوروس المناعي - أداة جديدة للكشف عن العدوى

للمزيد

ما هو اختبار خط الأساس إذا كنت مصابة بالسارس- CoV-2؟

تجميع الاختبارات ("التجميع" أو التجميع): لماذا و لماذا؟

كم من الوقت يظل الفيروس التاجي معديا؟

ايجابيات كاذبة ، السلبيات الكاذبة ، حساسية ، خصوصية اختبارات COVID : ما الذي نتحدث عنه؟

ما هي طرق الكشف عن الأشخاص المصابين بالعدوى عند مدخل حانة أو طائرة؟

هل البصق على الأرض خطر على الآخرين؟